實驗室
學生實驗室之建置
目前本系(所)建置之學生實驗室有一樓之【生物安全檢測實訓基地】(U-116)及五樓之【生技藥學實驗室】（U-540、U-542）、【生技生物性實驗室（U-536、U-538）】，【生技化學性實驗室】(U530、U532)作為學生實習主要場所，共約176坪專屬系科使用空間。部分課程則是使用本院其他系之空間，如生物學實驗(藥學系實驗室U106)、儀器分析與實習(藥學系實驗室U146)、化學檢驗分析與實驗(食品系生物化學實驗室U436)，此3間實驗室各59坪，共177坪。另外尚有U519研究所專用教室、滅菌室、系學會辦公室、儲藏室等空間。
教師研究空間之建置
依本校【教師空間規劃】辦法，助理教授以上每人配置研究室一間以及每二名助理教授以上教師配置實驗室一間。目前本系教師共有8位，共配置教師研究室9間，教師實驗室8間，依教師研究專長共分為【微生物檢測研究室】、【保健食品研究室1】、【珊瑚礁生理生態研究室】、【藥食用菇類檢測分析研究室】、【營養免疫實驗室】、【毒性物質檢測分析研究室】、【保健食品研究室2】、【高分子實驗室】。每位教師個人實驗室約14.5坪，而U536、U538、U540、542則是系上共同實驗室，主要放置系上整體發展經費所購置之共同儀器，系尚可使用空間的充足度有助於系(所)研究與教學發展。
動物實驗中心
本校為配合教學及研究需要，於【達文西大樓】九樓設置動物中心，其佔用面積約為90坪。動物中心實驗動物之進出管制、飼養管理及環境衛生設備皆能符合農委會之相關規定，實驗動物中心之設置對教學及研究有非常大的助益。
貴重儀器中心
本校貴重儀器中心創立於民國89年，93年生物科技(達文西)大樓落成，保留二樓空間設立貴重儀器與育成中心，並建立貴儀實驗室所有硬體設備(實驗桌、抽風櫥等)。硬體規劃：精密儀器室2大間(90坪)、樣品準備實驗室2間(60坪)、微生物檢驗實驗室1間及藥品/文件/辦公/會議室6間，合計約300坪 (1,000平方公尺)，規劃為『食品藥物暨環境認證檢驗中心』實驗室專屬設置之空間。中心提供化學性與生物性樣品處理/儀器分析設備，進行食品安全、環境安全、生物科技、藥學等各項檢驗分析項目之認證及檢驗服務。
目前中心有化學性檢驗實驗室，配備有UPLC/PDA/Fluor、LC/MS、LC/MS/MS、IC、GC/MS、GC/FID、ICP-OES、AA等多項貴重儀器；及生物性檢驗實驗室(建立中)。鑑於目前食安問題非傳統方法可以把關，檢驗方法、項目眾多，中小企業人力/財力之限制，無法建立先進儀器設備之實驗室等各項因素，因而我們以【中央實驗室】之理念，創新產學合作模式，降低產業成本，建立長期產學合作，自給自足，『中央實驗室』是以實質資源共享方式進行：『共享智財、共同研發、共育人才、共用校園資源』，有效率服務高屏地區食品、農業、藥學、及環境等相關產業自主管理，供教學及研究使用。